2023年宁夏南部地区鼠类汉坦病毒感染监测及病毒基因特征分析Monitoring of Hantavirusinfection in rodents in southern Ningxia in 2023 and analysis of virus genetic characteristics
杨东智,李龙山,詹军,曹慜,马学平
摘要(Abstract):
目的 了解宁夏南部地区鼠类动物感染汉坦病毒(Hantavirus, HV)感染情况,为宁夏地区肾综合征出血热的预防控制提供依据。方法 2023年春秋两季在监测点捕捉老鼠,采集鼠血和鼠肺标本,采用间接ELISA法检测鼠血中抗汉坦病毒IgG抗体,用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)方法检测鼠肺汉坦病毒核酸,核酸阳性标本进行全基因组测序。采用BEAST软件构建贝叶斯系统进化树。结果 共捕获鼠类动物1 297只,鼠血汉坦病毒IgG抗体阳性率为26.4%,标本阳性率春季(19.5%)高于秋季(6.9%),差异有统计学意义(χ~2=89.26,P<0.05);野外环境与居住区的鼠血IgG抗体阳性率分别为14.2%和12.3%,差异无统计学意义(χ~2=2.10,P>0.05)。鼠肺的汉坦病毒核酸阳性率为0.62%(8份),阳性标本均为秋季、外环境采集,主要来自泾原县(占75.0%)。成功测得8份汉坦病毒基因组M和S全长序列,均为汉滩型汉坦病毒(HTNV),M和S基因核苷酸同源性为95.10%~100.00%,S片段核苷酸与陕西省汉坦病毒序列(OP094683_Shaanxi_2020)一致性为96.30%~98.41%;与国际标准株(GenBank号:KT885048)的核苷酸一致性为85.37%~87.07%;M片段核苷酸与陕西省汉坦病毒序列核苷酸一致性为93.10%~95.50%.与国际标准株核苷酸一致性为83.50%~85.10%。贝叶斯系统进化树显示宁夏鼠类动物汉坦病毒形成一个独立支系,与陕西省2020年分离株基因组核苷酸序列一致性较高(95.81%)。8个汉坦病毒M和S片段编码区氨基酸序列与国际标准株(KT885048)相比分别发现15个和12个变异位点。结论 宁夏南部地区存在一定的肾综合征出血热流行风险,流行的HTNV为独立的新进化分支,具有独特基因特征。
关键词(KeyWords): 肾综合征出血热;汉坦病毒;基因组;序列测定;系统发育树
基金项目(Foundation): 宁夏自然基金项目(2023AAC03714)
作者(Author): 杨东智,李龙山,詹军,曹慜,马学平
DOI: 10.13668/j.issn.1006-9070.2025.03.015
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